此前被曝光存在“未批先建”等違法行為的海南省三亞新機場項目，其環(huán)境影響報告已遭國家海洋局否定。

2017年11月8日，國家海洋局辦公室回函環(huán)保組織自然之友稱，因該項目涉嫌違法用海，國家海洋局已暫停審查該項目用海預審申請。 

據(jù)《財新周刊》2017年6月報道，由海航集團興建的三亞新機場人工島填海項目，剛在國家海洋局官網(wǎng)公示、尚未完成審批，就已經(jīng)在三亞紅塘灣海域開工。“搭便車”上馬的三亞新機場臨空產(chǎn)業(yè)園旅游產(chǎn)業(yè)園（蓮花島）填海項目也在強勢推進，超過其一期工程獲批的面積建設(shè)，并且未按環(huán)評批復要求的方式填海。（參見2017年6月12日《財新周刊》文章《三亞新機場填海之患》）  

國家海洋局在上述回函中表示  

2017年4月，國家海洋局在收到三亞新機場人工島項目環(huán)境影響報告書后，依法進行了技術(shù)審查、公示、征求意見、聽證等審批程序，因報告書存在較多問題，國家海洋局于7月對報告書作出“不予批準”的決定。

此外，三亞臨空產(chǎn)業(yè)園（蓮花島）一期填海工程為海南省審批的項目，不屬于國家海洋局受理范圍。

自然之友環(huán)境公益訴訟項目負責人葛楓向財新記者介紹，他們從三亞市海洋漁業(yè)局網(wǎng)站發(fā)現(xiàn)，規(guī)劃總面積418公頃的蓮花島被劃分成了多個填海面積小于50公頃的小項目報批，也就是國家明令禁止的“化整為零”，“國家海洋局的此次回復也側(cè)面印證了這一點。”  

依據(jù)《海域使用管理法》，超過50公頃的填海項目，必須上報國家海洋局和國家發(fā)改委審批；50公頃以下的項目，則由省級政府審批。為規(guī)避國家審批，很多地方將圍填海規(guī)劃“化整為零”，把一個填海項目分解為若干個不同名目的工程，分次在省級審批。  

國家海洋局還表示，經(jīng)有關(guān)部門核查，對三亞新機場相關(guān)項目共查處違法案件9起，辦結(jié)4起，其余案件正在辦理中，三亞新機場填海工程項目已于7月25日全面停工。  

該項目總投資1088億元，占地約25平方公里，屬特大型填海海洋工程，所在的位置又毗鄰三亞珊瑚礁國家級自然保護區(qū)，項目所在灣區(qū)本身也生長著大量珍貴珊瑚，同時也是國家一級保護動物中華白海豚繁育、覓食的場所，一直受到相關(guān)專業(yè)人士的高度關(guān)注。 

 
在《財新周刊》報道發(fā)表后，海南省省長沈曉明和常務副省長毛超峰均對報道作出批示，三亞新機場填海的違法違規(guī)行為也受到了各級海洋部門的重視。8月16日，財新記者在海南省三亞市紅塘灣新機場填海現(xiàn)場看到，海洋局已用鐵門將進入填海區(qū)域的棧橋封鎖，門上掛有“監(jiān)管區(qū)域閑人免進”的標志牌。據(jù)介紹，自2017年7月起，新機場填海工程已全面停止施工，施工工程船已全部撤離，現(xiàn)場已無施工作業(yè)情況。 

 
海南省海洋與漁業(yè)廳8月15日在官網(wǎng)稱，三亞紅塘灣海域圍填海存在違法違規(guī)占用海域、未批先建等情況，截至7月11日三亞紅塘灣涉及違法用海面積99.12公頃，其中填海89.26公頃；非透水性構(gòu)筑物7.92公頃，透水構(gòu)筑物1.94公頃。2016年以來，海南省各級海監(jiān)機構(gòu)對三亞紅塘灣海域違法填海行為和違法采砂行為立案25宗。  

據(jù)國家海洋督察組于9月6日通報，針對三亞市新機場違規(guī)填海問題，已經(jīng)約談了項目業(yè)主，要求其全面停工，接受處罰。海監(jiān)執(zhí)法部門已立案查處8起違法行為，3宗已繳納罰款；5宗正在調(diào)查處理。現(xiàn)場依法設(shè)立動態(tài)監(jiān)管、海洋環(huán)境工作站、海監(jiān)工作站，每天派出人員監(jiān)管、現(xiàn)場監(jiān)測。